El centro nació en 1969 en el seno de la Universidad de Valladolid, con la sección de Físicas como especialidad.Tres años después, la Facultad de Ciencias fue el germen de la Universidad de Santander junto a la Escuela Técnica Superior de Ingenieros de Caminos,Canales y Puertos y la recién creada Facultad de Medicina. En 1977 se implantó la sección de Matemáticas, continuando así con la oferta académica a la que los alumnos pueden acceder desde entonces.

En todo este tiempo la Facultad se ha ido haciendo con una plantilla altamente competente de profesorado; entre éstos se cuentan académicos, premios de investigación, miembros de comisiones de expertos científicos a nivel internacional y otros profesionales de reconocido prestigio. En definitiva, la Facultad de Ciencias es uno de los centros más antiguos y con mayor solera de la Universidad de Cantabria y presenta una inequívoca vocación de futuro.

En la actualidad se imparten las siguientes titulaciones

• Licenciado en Física (a extinguir)
• Licenciado en Matemáticas (a extinguir)
• Ingeniero en Informática (a extinguir)

• Grado en Física
• Grado en Matemáticas
• Grado en Ingeniería Informática
• Diploma in Experimental Physics

• Postgrado Oficial en Ciencias, Tecnología y Computación      

            Programas de doctorado adaptados al EEES

Doctorado Ciencias, Tecnología y Computación

• Máster en Física y Tecnologías Físicas
• Máster en Computación
• Máster en Nuevos Materiales
• Máster Interuniversitario en Nuevos Materiales U. Cantabria-U. pais Vasco/EHU.

Doctorado Matemáticas y Computación

• Máster en Matemáticas y Computación

Doctorado en Química Teórica y Modelización Computacional

• Máster Europeo en Theoretical Chemistry and Computational Modelling

El Ministerio de Educación ha concedido la Mención hacia la excelencia a los tres programas de doctorado. La Mención se concede para los cursos académicos 2011-12, 2012-13 y 2013-14. Los programas de doctorado con Mención hacia la excelencia contituyen un referente internacional, y la relación de los mismos se incorporará al Sistema Integrado de Información Universitaria del Ministerio.