Este departamento desarrolla una intensa actividad investigadora que se refleja en una alta productividad científica, refrendada por publicaciones en revistas de prestigio internacional.

Entre otras actividades estables, el departamento mantiene un Seminario de Investigación, contribuye a la gestión del Centro Internacional de Encuentros Matemáticos (CIEM) y coordina el Instituto GeoGebra de Cantabria. Junto con el Departamento de Matemática Aplicada y Ciencias de la Computación, lleva el peso del Doctorado en Matemáticas y Computación.

Varios investigadores del departamento han recibido premios a lo largo de los últimos años en los campos de las Matemáticas y la Computación.

Además de la docencia impartida en titulaciones oficiales, el departamento desarrolla una amplia labor de formación y divulgación abierta a la sociedad: programa Estalmat Cantabria (estimulación del talento matemático en la adolescencia), talleres "Matemáticas en Acción", organización de Olimpiadas Matemáticas, etc.